Bohaterami „Głębokiej wody” są osoby pracujące w jednym z Ośrodków Pomocy Społecznej. Ich liderem jest Wiktor Okulicki (w tej roli Marcin Dorociński), świeżo mianowany dyrektor Ośrodka, człowiek czynów, a nie słów.
Akcja każdego z trzynastu odcinków skupia się na jednej sprawie, konkretnym dramacie i jego bohaterze, któremu zespół Wiktora, składający się z Miki, Aliny, Małgosi, Krystyny i Jerzego, stara się pomóc. Serial pokazuje też życie prywatne głównych jego postaci.















